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艾滋病病毒和HPV病毒是兩種不同的病毒，沒有關(guān)聯(lián)性，除了在傳播途徑上都可以通過性接觸傳播之外，再無相同之處。
HPV病毒也稱為人乳頭瘤病毒，人乳頭瘤病毒是球形的DNA病毒，能夠引起皮膚黏膜的鱗狀上皮增殖，表現(xiàn)為尋常疣、生殖器疣等癥狀，可以引起尖銳濕疣、宮頸癌、肛門癌等疾病。
艾滋病病毒是RNA病毒，主要傷害的是人體免疫系統(tǒng)中最重要的CD4+T淋巴細胞，艾滋病病毒也稱為人類免疫缺陷病毒。感染艾滋病病毒之后，可以導致人體免疫缺陷，從而會出現(xiàn)多種機會性感染，引起多臟器的嚴重并發(fā)癥，可以危及生命。在性接觸中正確使用安全套，可以阻止HIV病毒(即艾滋病病毒)的感染，但是不能完全阻止人乳頭瘤病毒的感染。
人乳頭瘤病毒引起的尖銳濕疣預(yù)后較好，但是治療之后容易復(fù)發(fā)。目前在全世界范圍內(nèi)，還沒有能夠根治HIV病毒的有效藥物，現(xiàn)階段針對于艾滋病的治療主要是抗病毒治療。