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先天性心臟病的主要原因是家族史，遺傳因素占很大一部分，因為機體的染色體異常，還有基因異常所導致。另外，孕婦在懷孕早期前3個月的時候，孩子重要臟器形成的關鍵階段，發(fā)生了病毒感染或者是風疹病毒、柯薩奇病毒感染引起的動脈導管未閉，還有肺動脈口的狹窄，也可以造成心內膜的彈力纖維增生；或者是身處在高原地區(qū)，因為缺氧引起來的動脈導管未閉，還有房間隔缺損先心病的發(fā)生率很高的。有些先天性心臟病可能和性別傾向有關系，環(huán)境因素也占一部分。