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做腸鏡前的準備工作主要包括腸道準備，要喝一些瀉藥把腸道內容物徹底清理干凈，使腸腔沒有其他的大便等等。
在做腸鏡時可以清楚觀察到腸道黏膜的情況，有無腫瘤、息肉、炎癥、潰瘍等等。
腸道準備之后還需要在做腸鏡前抽血化驗傳染四項來確定有無傳染病，同時還需要檢查凝血功能是否異常。
如果凝血功能有異常的要停止做腸鏡，如果有傳染病的要針對性使用相應腸鏡，在做完后腸鏡后做單獨的消毒處理。