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大部分抗NMDA受體腦炎患者預(yù)后較良好，不遺留或較少遺留后遺癥，部分患者會遺留不同類型的后遺癥，主要包括以下幾種;

1、癲癇：最常遺留，也叫癥狀性癲癇，發(fā)生率最高。大部分患者即使腦炎治愈，但由于顳葉和邊緣系統(tǒng)受過損害，會遺留一定致癇灶，在恢復(fù)過程中，甚至完全康復(fù)后，還會遺留各種類型癲癇發(fā)作；

2、智能減退：由于抗NMDA受體腦炎主要攻擊大腦皮層，因此即使功能恢復(fù)，仍有部分患者會遺留不同程度智能下降，如忘事、記憶力減退，或者是反應(yīng)遲鈍；

3、語言障礙：部分患者會遺留語言障礙，如青少年、小孩子及語言功能發(fā)育不佳的患者，在腦炎治愈后，會遺留一定的語言發(fā)育遲緩，甚至講話功能減退，如找詞困難、用詞不當(dāng)，以及不同類型失語；

4、精神癥狀：由于抗NMDA受體腦炎累及額顳葉以及邊緣系統(tǒng)，上述部位與精神活動密切相關(guān)。因此部分患者會遺留一定程度精神癥狀，如幻覺、妄想、沖動等過度型人格特征。