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如果淋球菌檢測出現(xiàn)陰性，首先區(qū)分是真陰性或假陰性。如果是假陰性，治療方案與淋球菌感染陽性的治療方式相同。如果是真陰性，很多是因為經(jīng)過有效的治療，患者的癥狀得到改善，復查淋球菌會顯示陰性，這種陰性結(jié)果無需進行治療。

淋球菌假陰性主要與實驗室檢測方案有關(guān)，臨床中比較常見的淋球菌的涂片檢測用于檢測無并發(fā)癥的男性尿道膿性分泌物，敏感性高。對于女性患者來說，宮頸炎陽性率僅50%，另外50%女性患者有宮頸炎，但檢測會出現(xiàn)假陰性的結(jié)果。

目前，淋球菌的檢查除涂片外，還可以采用更加敏感的核酸檢測的方法，敏感性高，且對于無癥狀者的檢出率也更高，可以避免涂片檢查導致出現(xiàn)假陰性結(jié)果。